SARS-CoV-2快速核糖核酸测序

500vip正在为以前被确定为SARS-CoV-2阳性的样本提供快速测序服务. 这项服务同时提供给国民健康保险制度和独立部门的实验室.

样本可每周7天(24/7)进行测序:

5级测序
500vip
光环的建筑
伦敦Mabledon广场1号
WC1H 9 ax

如有任何转诊化验室或处理诊所以前未将样本转诊至本处,本处会按要求向其发出新帐户设置表格. 如需设置表格,请联系 sequencing@thegolfscribe.com

结果将报告为常规病理服务.
 

送检样品类型

首选的样本类型是提取核糖核酸,如果没有可用的核糖核酸,初级临床样本也将被接受.

每个样品的核糖核酸提取方法以及提取和洗脱体积的详细信息必须包含在申请表中.

 

核糖核酸

这是送去500vip的首选材料. 为最好的结果, 在您的实验室收到样品后,应尽快准备核糖核酸,以防止降解.

  • 样品不应暴露在极端温度下, 必须避免冻融循环,以防止核糖核酸样品降解(从初次500vip到到达TDL,最多2个循环). 核糖核酸降解会导致低质量或测序失败.
  • 核糖核酸样本应始终用干冰(零下80°C)运输,并由经批准的快递服务.
  • 样品量必须记录在申请单上. 核糖核酸样品的最小体积为20μl
  • 样品在到达500vip之前绝不能被稀释.
  • 样品应放在专有的洗脱缓冲液中.g. Qiagen(凯杰)EB、TE缓冲液或分子级RNase-free水.

 样品应以不含rnase的分子级塑料器皿储存和运输.

  • 在可能的情况下,样品应装在标有清楚标签的单个试管中运输.
  • 如果同时有超过20个样本被提交给TDL, 这些可以以样板的格式发送,只要附有样板清单和清晰的样板图.
  • 每个样品的Ct值和pcr检测方法也应在申请单上注明. Ct值大于35的样本不应参考测序,因为这些水平可能会降低测序数据的质量.

主要的样品

  • 在没有核糖核酸的情况下,初级样本不是送往测序分析的首选样本, 一次样品的最小体积为250μl.
  • 样品在运输前应保存在4°C - 8°C,但在环境温度下发送给TDL.
  • 不要将样品置于冻融循环或极端温度下.
  • 当日送达快递是首选的送货方式. 参考的延迟可能会影响结果的周转时间.
  • 请在申请单中包括使用的SARS-CoV-2 PCR方法和Ct值. Ct值大于35的样本不应参考测序,因为这些水平可能会降低测序数据的质量.

样品在寄往:

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光环的建筑
伦敦Mabledon广场1号
WC1H 9 ax

请将申请表副本连同样本一并递交.申请表不能与样管或样片接触.

 

申请表格和清单样例

请在每个样本中附上一份完整的测序申请表(可以通过电子邮件提供), 表示测序的样本类型. 所有的申请表格必须尽可能的完整. 最低限度,所需资料应包括:

  • 指TDL的化验所/诊所名称
  • 样本编号/标识和样本类型
  • 样本日期
  • 核糖核酸提取方法,或表明TM或分析缓冲液使用
  • SARS-CoV-2 PCR结果(Ct值)

如果大量的核糖核酸样本同时被提交给TDL,它们可能会被分批处理
并以96孔微量滴定板格式发货, 确保包括样板布局在内的样板清单包括纸质和电子格式. 这必须在请求表格和电子邮件发送到sequencing@tdlpathology的电子格式中注明.com

 
包装

样品必须按照ACDP危害组3标本进行包装和管理. 详情请浏览以下连结:
患者样本的包装和运输要求- UN3373 - GOV.UK

UN3373标签必须在外包装上清晰可见,以便:

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运输

所有要求测序的实验室负责安排将所有标本转送给TDL的适当运输. 符合运输法规是先决条件,所有包装都应该清楚地贴上标签,并可见显示UN3373 P650标签.


报告、发票和查询

测序结果将报告给需要的实验室作为常规结果. 在将样本转交给TDL进行测序之前,必须提供任何实验室或加工诊所的详细信息.

测序费用为250英镑.每个样品00美元,并按月开具发票.
不收取增值税.

任何查询都应该指向sequencing@tdlpathology.请致电0709 988 969与TDL遗传学主任Lisa Levett博士联系.